История начала разворачиваться в момент, когда автопилотом управлял пассажирский самолет из Германии, приземлившийся в Бостонском аэропорту. Экипаж не смог установить связь с диспетчером и, позднее стало известно, что все люди на борту погибли от загадочного вируса. Подозревая террористическую атаку, правительство решает собрать команду лучших спецслужб для расследования этого дела. В этой группе находится молодой агент ФБР Оливия Данэм, в паре с ее напарником и лучшим другом Джоном Скоттом. Они преследуют основного подозреваемого и в ходе обыска лаборатории происходит взрыв, после которого здоровье Джона стремительно ухудшается. Симптомы болезни настораживают, а развитие событий грозит стать трагическим. Чтобы раскрыть дело и отомстить за своего друга, Оливия обращается за помощью к эксцентричному ученому Уолтеру Бишопу и его гениальному сыну Питеру. Вместе они исследуют происходящее с научной точки зрения. Агент Данэм осознает, что подобные инциденты происходят регулярно. Кто-то экспериментирует с наукой, выбрав Землю и ее обитателей в качестве своих испытуемых.